Wer in Stralsund Quartier nimmt, sollte sich keinesfalls den Besuch des Meeresmuseums entgehen lassen. In Dauerausstellungen und großzügigen Aquarien präsentierte Meeresfauna und -flora im ehemaligen Katharinenkloster, gleich neben dem Kulturhistorischen Museum, machen Meereskunde, Meeresbiologie, Wale und Delphine sowie Fischereiwirtschaft hautnah erlebbar.
Die Abteilung "Mensch und Meer" und der Ostseerundgang vermitteln anschaulich den aktuellen maritimen Informationsstand. Besondere Exponate des Hauses sind z. B. ein 15m langes Finnwalskelett und eine japanische Riesenkrabbe. Das Aquarium mit Lebewesen aus der Nordsee, der Ostsee und den Tropen lässt Besucher in die faszinierende Aura der Unterwasserwelt eintauchen.
In der Außenstelle Nautineum Dänholm, dem Ausstellungszentrum für Fischerei, Meeresforschung, Gewässerkunde und Seewasserstraßen, warten ebenfalls viele Attraktionen. Das beeindruckende Unterwasserlabor "Helgoland" kann von innen bestaunt werden - ebenso wie die 14 m hohe Bootshalle, die das Museums-Zeesboot STR 9 beherbergt.
Die multimediale Erlebnisausstellung Meeres-Welten zum Anfassen, Erfahren und Staunen, präsentiert Themen wie maritime Naturphänomene, die Bedrohung und Zukunft der Meere sowie das Meer in Kulturgeschichte und Kunst.